Το Πεκινουά αποτελεί μία από τις αρχαιότερες ράτσες σκύλων. Eμφανίστηκε στην Κίνα πριν από 2000 περίπου χρόνια και ήταν το αγαπημένο ζώο του Κινέζικου Αυτοκρατορικού Οίκου. Το Πεκινουά λατρευόταν σαν ημίθεος από τους Κινέζους ενώ οι κοινοί θνητοί απαγορευόταν να έχουν στην κατοχή τους πεκινουά και έπρεπε να υποκλίνονται μπροστά του. Η κλοπή του τιμωρούνταν με θάνατο και όταν ένας αυτοκράτορας πέθαινε, το Πεκινουά του θυσιαζόταν ώστε να πάει μαζί του και να τον προστατεύει και στην άλλη ζωή.
Όταν τα βρετανικά στρατεύματα εισέβαλαν στο παλάτι στο Πεκίνο το 1860, πέντε σκύλοι μεταφέρθηκαν στην Αγγλία ως λάφυρα πολέμου. Έναν απ' αυτούς τον έκαναν δώρο στη Βασίλισσα Βικτόρια. Αυτοί ήταν οι πρόγονοι της σημερινής φυλής.
Η ράτσα επιδείχτηκε για πρώτη φορά στην Αγγλία το 1893 και μεταφέρθηκε στην Αμερική λίγα χρόνια αργότερα.